Соединенные Штаты поддерживают постоянные официальные дипломатические отношения с Эстонской Республикой, начиная с 28 июля 1922 года. Фредерик В.Б. Коулман из Миннесоты был назначен первым Чрезвычайным и Полномочным посланником в странах Балтии 20 сентября 1922 года. Он представил свои верительные грамоты в Таллинне 20 ноября 1922 года.

С 1919 по 1922 год интересы США в отношении Эстонской Республики представлял Специальный уполномоченный США, базировавшийся в Риге (Латвия) и консул США в Таллинне. Эстонские дипломаты были аккредитованы при Государственном департаменте США с 1922 года, и консульские представители Эстонии действовали в Соединенных Штатах непрерывно, начиная с 1920 года.

После незаконной оккупации Эстонии Советским Союзом 17 июня 1940 года, заместитель Госсекретаря США Самнер Уэллс 23 июля 1940 года выступил с заявлением, которое послужило основой официальной политики непризнания правительством США. В результате, Соединенные Штаты никогда не признавали насильственного присоединения Эстонии и других балтийских республик — Латвии и Литвы, к Советскому Союзу.

После восстановления законной независимости Эстонии 21 августа 1991 года, Соединенные Штаты — 2 сентября 1991 года — объявили о своей готовности восстановить полноценные дипломатические отношения с Эстонской Республикой.

Посольство Соединенных Штатов Америки начало официально функционировать в среду, 2 октября 1991 года, в двенадцать часов дня, во временных помещениях канцелярии, расположенных в отеле «Палас».

Роберт К. Фрейжер из Западной Вирджинии был назначен первым Чрезвычайным и Полномочным послом США в Эстонии 23 марта 1992 года. Он вручил свои верительные грамоты 9 апреля 1992 года.

Дипломатическая миссия США в Эстонию возобновила свою деятельность в нынешнем здании посольства США, расположенном на улице Кентманни, 6 февраля 1992 года — в том же самом здании, в котором размещалось дипломатическое представительство США в Эстонии с 1 апреля 1930 года, пока оно не было вынуждено закрыться 5 сентября 1940 года.